No ano de 2005, com a criação da Universidade Federal da Grande Dourados (UFGD) em 29 de julho de 2005, o Sindicato dos Trabalhadores da Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (SISTA-UFMS) alterou seu nome para Sindicato dos Trabalhadores das Universidades Federais do Estado de Mato Grosso do Sul (SISTA-MS) de modo a atender às duas IFES do estado. Em 10 de junho de 2014 é fundado o Sindicato dos Trabalhadores em Educação das Instituições Federais – SINTEF, com sede e foro na cidade de Dourados/MS.